少年三国志零作为策略卡牌游戏，其核心特色在于颠覆传统的布阵系统与兵种协同机制。游戏采用16格站位布局，玩家需根据敌方阵容动态调整主将与士兵的站位，步兵、盾兵仅能部署于前两排，弓手与谋士限制在后排，而骑兵则可自由穿梭于全战场。这种设计强化了兵种克制的策略性，例如轻骑擅长突袭后排，盾兵能有效抵御冲锋，不同兵种的搭配直接影响战局走向。战斗中最多支持128名士兵同屏作战，士兵并非单纯装饰，而是具备独立血量和攻击判定的战斗单位，需与主将技能联动形成战术配合。
游戏另一创新点在于军师系统的深度融入。军师并非被动增益角色，而是拥有独立技能树和战场干预能力的核心单位。黄月英可召唤拒马阻挡骑兵冲锋，郭嘉能释放范围沉默控制敌方主将，张宝则通过召唤黄巾傀儡干扰阵型。军师技能需手动释放且存在冷却时间，如何把握技能时机与范围成为胜负关键。四系计谋（火攻、水淹等）可组合触发额外效果，例如火攻叠加风系技能能扩大燃烧范围，这种技能联动机制大幅提升了战斗的策略深度。
特权玩法与联盟社交构成游戏的长期成长线。玩家达到9级后解锁爵位系统，通过功勋提升爵位可获得体力上限提升、扫荡权限等实用特权，每日特定时段登录还能领取额外体力。联盟不仅是资源交换平台，更支持玩家协同参与群雄逐鹿等领土争夺战，联盟科技升级可全成员共享属性加成，而弹劾机制和贡献排名则增添了权力博弈的社交趣味。联盟副本如华容道（塔防模式）和长坂坡（近战生存）要求成员根据关卡特性调整阵容，考验团队策略默契。
演武场与赛季兵典是检验战术理解的试炼场。演武场分为近战篇、布阵篇等主题关卡，强制使用特定兵种破解敌军阵型，例如面对回复型主将时需优先派遣高爆发弓手集火。赛季兵典则设计为进阶挑战，如八极篇要求利用刘备的复活特性抵挡骑兵冲锋，配合拒马和箭塔构建防御工事。这些玩法不仅要求熟悉兵种特性，还需预判敌方技能释放节奏，通过反复调整站位与技能序列实现最优解。
宝物养成与赤壁之战共同构成游戏的深度策略层。26级开放的宝物系统可通过洗练激活套装效果，例如提升弓手暴击率或步兵伤害减免，需根据主力阵容定向强化。赤壁之战作为资源获取的核心副本，敌方阵容具有明显倾向性，例如多轻骑阵容需优先布置盾兵防线，而BOSS战则依赖弓手拉开距离持续输出。该系统强调对敌方弱点的实时分析，无法依赖单一阵容通解所有关卡。
